20.000 espècies d'abelles narra la història de la Cocó, una nena de 8 anys, que no encaixa amb les expectatives de la resta i no entén per què. Al seu voltant tots insisteixen a anomenar-lo Aitor, però ella no es reconeix en aquest nom ni en la mirada dels altres.

L'Ane, la mare de la Cocó, bolcada en una crisi professional i sentimental, aprofitarà les vacances per viatjar amb els seus tres fills a la casa materna, estretament arrelada al cultiu d'abelles i a la producció de mel. Al poble, l'Ane intentarà ocultar la seva situació davant de tothom per desconnectar i descansar. La Cocó, en canvi, veurà les vacances com una oportunitat per mostrar-se com la nena que és.